本刊历史悠久，1938年8月出版了《云南大学学报》第二类（数理版）第一号，为外文版，第1篇为世界著名数学大师的论文“Om Two Affine Connections”(两类仿射联络)。改革开放以来，学报立足本校，面向社会，取得了长足进步，在学术质量，编排规范化，标准化，编辑部现代化建设方面，成绩显著。近10多年来，共获省部级奖9次。