本刊是1978年创刊，当时是《国外医学》系列期刊之一，原名为《国外医学——分子生物学分册》，系检索类刊物，为我国的医学分子生物学的发展起到了应有的作用。2004年，为顺应时代的发展，我刊更名为《医学分子生物学杂志》，由检索情报类变更学术类刊物，实时报导医学分子生物学领域的新进展，新成果，反应良好，为我国的医学分子生物学发展作出了贡献。